COVID-19, известный с начала 2019 года, продолжает мутировать, производя многочисленные штаммы вируса SARS-CoV-2. Болезнь, вызванную различными штаммами, обсуждают медики и общественность, поскольку она вызывает много вопросов. Мы ответим на наиболее важные вопросы, связанные с генетическими вариантами коронавируса.

В микробиологии термин "штаммы" используется для описания культур, полученных из одного и того же источника и в одном месте в одно и то же время. Однако культуры, полученные из того же источника, но в разное время, могут иметь разные штаммы. Хотя микроорганизмы разных штаммов могут принадлежать к одному виду, они различаются между собой. Внутривидовые различия несущественны.

Как пример можно привести коронавирус. Вирус SARS-CoV-2 - виновник последней пандемии COVID-19 - является одним из многих коронавирусов. За время пандемии образовалось несколько штаммов SARS-CoV-2. Эти штаммы различаются между собой геномом, то есть набором генов.

Важно отметить, что вирусы, в том числе и SARS-CoV-2, не являются клетками, а являются носителями генетической информации. Они имеют особую структуру - вирусная частица окружена капсулой и внешней оболочкой, а внутри капсулы находится одна или две молекулы нуклеиновой кислоты. Коронавирус является одноцепочечным РНК-содержащим. Его геном закодирован в единственной молекулярной цепи рибонуклеиновой кислоты.

Штаммы образуются в результате генных мутаций, когда дочерние вирусы немного отличаются от родительских по генетическим характеристикам. Штаммы коронавируса отличаются друг от друга по скорости распространения и клиническим проявлениям инфекционного заболевания. Благодаря генетической изменчивости коронавируса образуется устойчивость к иммунной системе и медикаментозным препаратам.

В данной статье мы ответили на основные вопросы, связанные со штаммами коронавируса, их опасностью и мерами предосторожности.

Какие штаммы коронавируса уже известны? Согласно Всемирной организации здравоохранения, каждый из штаммов SARS-Cov-2 обозначается буквой греческого алфавита: альфа, бета, гамма и т. д. Изначально, коронавирусные штаммы назывались по странам, в которых они были впервые обнаружены. Таким образом, Британия, Южная Африка и Бразилия были связаны соответственно с британским, южноафриканским и бразильским штаммами коронавируса, а индийский штамм получил название дельта.

Однако, такое название, основанное на географической локации, несет в себе отрицательную окраску, так как может привести к обвинению всей страны в распространении COVID-19. Поэтому, исходя из соображений политкорректности, ВОЗ изменит классификацию имеющихся штаммов коронавируса. Старые названия штаммов все еще могут использоваться в медицинских исследованиях.

В новой классификации штаммов коронавируса ВОЗ использует греческий алфавит вместо названий, связанных со странами. Однако, некоторые буквы из алфавита были пропущены, чтобы не вызывать паники или ассоциаций, например, с Китаем. Пятнадцатая буква алфавита, омикрон, стала названием новейшего штамма коронавируса с начала 2022 года. Количество известных штаммов, отличных от первоначального, китайского варианта, составляет 13.

Опасные штаммы коронавируса COVID-19 можно определить по нескольким критериям. Во-первых, опасные штаммы обладают высокой контагиозностью - они легко передаются от человека к человеку. Во-вторых, эти вирусы имеют высокую вирулентность и могут вызывать патологические изменения в тканях организма даже в малых количествах. В-третьих, опасные штаммы характеризуются тяжелым течением коронавирусной инфекции и высокой вероятностью опасных осложнений и неблагоприятного исхода болезни. В-четвертых, возбудители этих штаммов устойчивы к действию вакцин и лекарств.

Организация ВОЗ подготовила список вариантов коронавируса, вызывающих опасения, который получил название VOC (Variants of Concern). В список вошли четыре коронавирусных штамма: альфа-штамм коронавируса, который был обнаружен в Великобритании, штамм из Южной Африки под названием бета-штамм, бразильский гамма-штамм и индийский дельта-штамм. В ноябре 2021 года ВОЗ дополнила список новым штаммом - омикрон. Также был разработан список генетических вариантов, вызывающих интерес (VOI - Variants of Interest), в который вошли штаммы с мутациями генома, которые в будущем могут привести к изменению эпидемиологических характеристик коронавируса. В список VOI вошли штаммы: эта-, йота-, каппа- и лямбда-штаммы. Если количество заболевших этими штаммами возрастет, ВОЗ переведет их из VOI в категорию VOC.

Как проявляется COVID-19, вызванный дельта-штаммом, и в чем его отличие от классического коронавируса?

Дельта-штамм коронавируса, выявленный в Индии, имеет более короткий минимальный инкубационный период, чем классический коронавирус, изначально обнаруженный в городе Ухань. Максимальный период инкубации по-прежнему составляет две недели.

Помимо стандартных симптомов COVID-19, таких как кашель, лихорадка, потеря обоняния и вкуса, дельта-штамм вызывает симптомы, характерные для расстройства желудочно-кишечного тракта, такие как тошнота, рвота и диарея. При этом встречаются боли в голове и горле. Самой уязвимой группой при заражении дельта-штаммом является молодежь в возрасте от 14 до 29 лет.

Источник: Роспотребнадзор. 2021. "Дюжина вопросов о «дельта»-штамме". Доступно по ссылке.

Переписка о дельта-штамме коронавируса становится все более актуальной.

Данный индийский штамм представляет серьезную опасность, поскольку передается значительно легче и быстрее, чем классический COVID-19. Если в случае последнего каждый больной мог заразить 2-3 человека, то в данном случае этот показатель увеличился до 5-8. Вирус имеет особенности клинического проявления, которые способствуют распространению инфекции даже тогда, когда заболевший еще не знает о своем состоянии. Например, первым симптомом может быть высокая длительная температура, что может быть неочевидно для зараженного.

Но опасность дельта-штамма заключается не только в его легком распространении. Этот штамм вызывает более высокую вирусную нагрузку в организме человека. На ее нейтрализацию требуются большие количество антител, что делает болезнь более тяжелой и увеличивает вероятность госпитализации. Особенно тяжело инфекция протекает при заражении новой модификацией - дельта-плюс коронавирусом.

Ситуация с дельта-штаммом коронавируса остается серьезной и требует максимальной внимательности.

Что отличает британский вариант коронавируса от SARS-CoV-2?

Сравнительно с классическим китайским вариантом, симптомы британской коронавирусной инфекции проявляются чаще и с большей степенью выраженности. Например, боль в горле и кашель чаще отмечаются при альфа-штамме. Но утрата обоняния происходит реже - только у 39% пациентов.

Кроме того, вирус на 90% более заразен, а болезнь протекает более тяжело. Частота госпитализации в случае заражения альфа-штаммом выше на 64%, повышая риск неблагоприятного исхода.

Но к счастью, на территории РФ уровень заболеваемости британским штаммом не так высок. В целом, хочется отметить, что на сегодняшний день выделены несколько вариантов коронавируса - альфа, бета, гамма, дельта - и они отличаются друг от друга по структуре и способности заразить человека.

С начала осени текущего года всеобщее внимание устремлено на очередной штамм коронавируса южноафриканского происхождения, который стал известен как омикрон. Он был выявлен впервые в ноябре 2021 года и продолжает вызывать у людей все большую тревогу по всему миру. Омикрон очень заразен и каждый день побивает новые рекорды по заболеваемости. Ученые сообщают, что если раньше COVID-19 преимущественно поражал пожилых и ослабленных людей с другими заболеваниями, то новый вирус начал атаковать даже детей.

Несмотря на то, что пока нет единого мнения среди специалистов относительно тяжести протекания инфекции и возможности неблагоприятных исходов, лабораторные исследования показали, что омикрон-штамм реже попадает в легкие и чаще поражает носоглотку, что значительно упрощает его передачу воздушно-капельным путем. Возможно, это и есть одна из причин за высокую заболеваемость.

Согласно данным, которыми располагают ученые, число летальных исходов от омикрона пока находится на уровне 0,1-0,2%, что примерно соответствует уровню смертности от других штаммов. Для получения более подробной информации о новом штамме коронавируса рекомендуем обратиться к биологу Константину Северинову, который дал ответы на 10 вопросов об омикрон-штамме в рамках интервью для журнала "РБК".

Как определить заражение конкретным вариантом коронавируса?

Каждый штамм вируса имеет свои характеристики. Например, один генетический вариант вызывает более легкую форму болезни, а другой может приводить к более тяжелым последствиям. Некоторые штаммы относятся к возрастным категориям, одни поражают пожилых людей, в то время как другие — всех возрастов.

Хотя различия в штаммах могут определяться поражением легких, носоглотки или желудочно-кишечного тракта, не следует полагаться на эти особенности.

Чтобы точно определить генетический вариант SARS-CoV-2, необходима объективная диагностика, такая как полимеразная цепная реакция (ПЦР) методом секвенирования. При этом изучают последовательность генов в молекулярной цепи. Хотя для проведения ПЦР необходимо сложное оборудование, процедура является довольно простой: мазок берется из носоглотки и ротоглотки. И это можно сделать как в условиях медицинского центра, так и на дому. Результат будет доступен уже через несколько часов, а их достоверность приблизительно равна абсолютной. Поэтому ПЦР признается "золотым стандартом" диагностики COVID-19.

Существует первая отечественная тест-система для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2. Детальнее о ней можно прочитать на информационном портале о генетике GENETICS. URL: https://genetics-info.ru/.

Вопрос о том, сохраняется ли иммунитет у человека после перенесенного коронавируса к другим его штаммам, остается открытым. После первого заражения в крови образуются антитела, которые пытаются уничтожить новые заражения. Однако возможно, что мутировавший коронавирус может плохо связываться с антителами, поэтому иммунная система может уничтожать не все, а лишь некоторые штаммы вируса.

Кроме того, временной фактор тоже имеет огромное значение. Со временем количество циркулирующих антител в крови уменьшается. Это означает, что эффективность защиты от последующих инфекций также может быть разной, в зависимости от времени, когда повторное заражение произошло, состояния иммунитета и вида мутации. В общем, ответ на вопрос о том, сохраняется ли иммунитет после перенесенного коронавируса, не является однозначным.

Фото: freepik.com